计算生物学 张岩 科学出版社 PDF电子教材 PDF电子书 大学教材电子版 电子课本 网盘下载(价值70元)【高清非扫描版】(2023年9月)

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图书简介:

本书是一本专门针对计算生物学领域的系统性教材,通过本教材的学习,可以掌握多种组学数据分析的原理和方法,包括高通量数据分析和单细胞测序数据的分析(第一章、第二章)、蛋白质组学及其功能预测(第三章)、计算表观遗传学(第五章)。在计算生物学的多学科应用上,本教材涵盖了分子进化的计算生物学分析(第四章)、计算癌症生物学(第六章)、计算免疫学(第七章)、药物设计的计算方法和应用(第八章)、影像组学与人工智能(第九章)、基因编辑系统的识别与功能分析(第十章)等应用内容,使读者能够掌握常用的基本算法、模型,从广度和深度突出解决生物学领域的计算需求。同时,在第十一章介绍了计算生物学领域的大数据资源及工具。

目录:

前言
绪论 1
第一节 计算生物学的起源和研究内容 1
第二节 计算生物学的数学、统计学基础2
第三节 计算机科学基础 7
本章小结 15
第一章 高通量数据分析 16
第一节 基因组组装 16
第二节 基因变异检测 19
第三节 RNA测序分析的基本方法 25
第四节 基因的注释 34
第五节 差异表达基因的筛选 36
第六节 基因功能的富集分析 39
本章小结 44
第二章 单细胞测序数据的分析 46
第一节 单细胞测序技术 46
第二节 单细胞转录组数据预处理 52
第三节 单细胞转录组数据分析方法 56
案例分析:单细胞转录组数据聚类分析61
本章小结 62
第三章 蛋白质组学及其功能预测 64
第一节 蛋白质组学概述 64
第二节 蛋白质结构预测 70
第三节 蛋白质功能预测 74
案例分析:蛋白质二级结构预测 80
本章小结 83
第四章 分子进化的计算生物学分析 85
第一节 分子进化的基本概念 85
第二节 系统发育树的构建 91
第三节 系统发育树的应用 102
案例分析:基于全基因组序列的新型冠状病毒(SARS-CoV-2)多算法系统发育树分析 104
本章小结 106
第五章 计算表观遗传学 108
第一节 基因组的DNA甲基化及数据分析 108
第二节 组蛋白修饰及数据分析 120
本章小结 127
第六章 计算癌症生物学 128
第一节 癌症生物标记亚型鉴定方法 128
第二节 癌症预警和风险评估模型 136
第三节 癌症个性化治疗 142
本章小结 145
第七章 计算免疫学 146
第一节 计算免疫学概述 146
第二节 肿瘤免疫浸润分析方法 148
第三节 肿瘤抗原鉴定的计算 156
第四节 T细胞受体的分析 164
案例分析:免疫细胞浸润算法工具的实践 167
本章小结 182
第八章 药物设计的计算方法和应用 184
第一节 药物性质计算 184
第二节 药物设计方法 191
第三节 精准用药 204
本章小结 206
第九章 影像组学与人工智能 208
第一节 影像组学 208
第二节 影像组学的分析方法 213
案例分析:构建卷积神经网络进行图片分类预测 223
本章小结 224
第十章 基因编辑系统的识别与功能分析 226
第一节 基因编辑系统概述 226
第二节 基因编辑技术的发展历程 226
第三节 基因编辑工具 229
本章小结 233
第十一章 大数据资源及工具 234
第一节 大型测序数据库 234
第二节 数据分析在线资源 250
本章小结 261
主要参考文献 262

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